Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms