Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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