Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45780-201ENSMUST00000212089 224 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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