Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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