Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ddx28Q9CWT6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ddx28Q9CWT6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ddx28Q9CWT6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ddx28Q9CWT6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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