Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms