Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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