Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sh3rf1Q69ZI1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sh3rf1Q69ZI1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms