Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms