Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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NfiaQ02780 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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NfiaQ02780 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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NfiaQ02780 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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NfiaQ02780 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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NfiaQ02780 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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NfiaQ02780 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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NfiaQ02780 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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