Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms