Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H3f3aP84244 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
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