Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms