Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms