Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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