Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms