Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Hmgcs2-201ENSMUST00000090746 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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