Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Zbed5B2RPU8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Zbed5B2RPU8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms