Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms