Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChmQ9QXG2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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