Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms