Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Abcg5Q99PE8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Abcg5Q99PE8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms