Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms