Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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