Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms