Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms