Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms