Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U6N9 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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