Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms