Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Apoa1Q00623 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms