Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CntfP51642 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CntfP51642 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CntfP51642 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CntfP51642 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CntfP51642 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CntfP51642 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CntfP51642 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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