Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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RxrgP28705 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RxrgP28705 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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RxrgP28705 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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RxrgP28705 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RxrgP28705 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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