Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nfkb1P25799 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms