Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TtrP07309 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TtrP07309 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TtrP07309 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TtrP07309 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TtrP07309 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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