Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4340L7N2C4 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms