Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms