Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms