Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp5Q9Z2P8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms