Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mbd1Q9Z2E2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms