Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd4Q9Z2D7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd4Q9Z2D7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd4Q9Z2D7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms