Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ilf3Q9Z1X4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ilf3Q9Z1X4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms