Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17h6s53eQ9Z1R4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms