Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lgr5Q9Z1P4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgr5Q9Z1P4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms