Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms