Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms