Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tusc2Q9WVF8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tusc2Q9WVF8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms