Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mixl1Q9WUI0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms