Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms