Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam50bQ9WTJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms