Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfebQ9R210 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfebQ9R210 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfebQ9R210 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfebQ9R210 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfebQ9R210 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfebQ9R210 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfebQ9R210 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TfebQ9R210 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TfebQ9R210 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TfebQ9R210 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TfebQ9R210 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TfebQ9R210 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TfebQ9R210 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfebQ9R210 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TfebQ9R210 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TfebQ9R210 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TfebQ9R210 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TfebQ9R210 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TfebQ9R210 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TfebQ9R210 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TfebQ9R210 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TfebQ9R210 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TfebQ9R210 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfebQ9R210 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms